Ну и что если устройство формирует какие либо импульсы кто вам мешает формировать реакцию с частотой 100МГц. В общем случаи для FPGA нужно делать синхронный проект где блоки будут завязаны на одну частоту если строить асинхронные проекты можно делать на CPLD там задержка распространения сигнала в кристалле фиксированная.