Делаем снимок виртуалки и всегда стартуем с него. Время наработки тоже тикать не будет. Можно для надежности все свои файлы всегда приводить к одним и тем же дате и времени скриптом. Т.е. у Вас всегда только что установленная копия стартует с некоторым набором Ваших файлов, у которых одна и та же дата и время.