С сожалением скажу что сомневаюсь в адекватности решения, вы забываете что вокруг реальный мир, у вас по СЧ получается контур C3-L нагруженный на резистор обратной связи, мало того что там начнутся биения всякие, так и помехоустойчивость решения может оказаться никакой. Я бы вернулся к варианту с получением нормальных 12В и затем грузил бы на реле. Для развязки помимо диода, параллельного катушке реле, поставил бы последовательный диод от стабилизатора к реле. Но если бы я изначально делал схему, я бы конечно не поставил его, наступил на те же грабли что и вы, и только потом начал думать как побороть генерацию.
Ещё вопрос зачем вы рвёте землю? Выключать реле? так для этого есть вход EN у стабилизатора... Сигнал только инверсный, но он у вас и так инвертируется на транзисторе.