Есть такое предположение: Этот кусок кода является подпрограммой??? Там дальше есть RET ???
Если есть, то возможно, после команды STD Z+3, R16 начинается точка входа другой подпрограммы:
entry1: LDI R30, LOW(KeyFun6E) ; PultFlags &= ~( 1<<3 | 1<<4 | 1<<0);
LDI R31, (KeyFun6E) >> 8
LDD R16, Z+3
ANDI R16, 0xE6
STD Z+3, R16
entry2: LDD R16, Z+3 ; PultFlags &= ~( 1<<3 | 1<<4);
ANDI R16, 0xE7
IN R17, 0x0E ; PultFlags |= PORTE & ( 1<<3 | 1<<4 );
ANDI R17, 0x18
OR R16, R17
STD Z+3, R16
...
RET