Всё равно ничего непонятно. Зачем подтяжки должны кого-то греть,
зачем они вообще нужны? У тебя вход ноги МК -- потенциальный, через
него ток же не втекает. Вниз контакты валкодера тянут, а вверх
резистор? Резистор тебе не сделать относительно высокоомным, т.к.
будет реагировать на помехи? Самое простое -- работать по опросу
("управляемая подтяжка"), а не прерыванию, просто ~20 раз в секунду
проверять вручную. Подали лог. 1 на верхний вывод резистора,
проверили напряжение на нижнем, дальше заснули. Два десятка тактов. Либо параллельно контакту добавить конденсатор (десятки нФ) и заменить резистор на высокоомный. Конденсатор зашунтирует токи ВЧ. Ёмкость конденсатора ограничена скоростью вращения ручки (должен успевать заряжаться).