Не важно когда именно генерируется прерывание, хоть на 42-м такте.
Важно, что в каждом цикле оно происходит одинаково, и длительность
цикла PR+1 тактов. При значении PR2=249 период должен 1мс
получаться. А microE выдаёт 1.001 при PR2=250, что тоже верно.