В примере для STM32L-DISCOVERY в коде инициализации линий
ввода-вывода есть такие строки (коменты мои):    Port_cfg_data.pin = PIN_ALL;
#if  DEBUG_SWD_PIN == 1
   /* -----------------04.10.2020 9:02------------------
    * PA15 (JTDI) used as standard GPIO, PA14 (JTCK-SWCLK)
    * used as debug port, PA13 (JTMS-SWDIO) used as debug port.
    * --------------------------------------------------*/
   Port_cfg_data.pin &= ~ ( PIN_13 | PIN_14 ); /* Exclude from ordinary config, leave debug pins in reset state */
#endif
Может и у вас где-то что-то подобное, а в документации скромная сторочка с сообщением, де, типа "если требуется отладочный интерфейс, задайте DEBUG_SWD_PIN".