Только сейчас вчитался, что вентиляторы на охлаждение. С ШИМ - да,
проблема. Можно поставить штуки три датчика на разные пороги
температуры и включить через них резисторы делителя, выход которого
подать на вход ШИМ вентилятора. Нередко вентиляторы со входом ШИМ
хорошо управляются просто постоянным напряжением - у них на входе
интегрирующая RC-цепь и на самом деле регулируются постоянкой.
Проверьте указания к применению ваших вентиляторов. Конечно,
управлять с контроллера настоящим ШИМом будет проще в обслуживании.