Если стабилизатор на 3.3В слаботочный (50-100мА), то может быть
просаживание питания от скачков потребления по выходам МК. Выходы
МК, настроенные на лог.1 при КЗ способны выдать нехилый ток. Если такой выход работает например на затвор мощного полевика (без резистора в затворе или с маленьким резистором) и коммутирует высоковольтный сигнал, то за счет проходной емкости полевика может возникать большой вытекающий ток на выходе МК. Если развязка по переменке на питании плохая (на ногах питания МК), то могут возникать провалы. Судя по ширине импульса, это действительно локальный провал из-за плохой развязки.