Делай монтажное "И"(или "ИЛИ" - какой там у тебя активный уровень)
на диодах и заводи результат хоть на одну EXTI. По ней и
пробуждайся. И заодно заведи свои сигналы на обычные ноги МК, чтобы
после пробуждения определить источник. Схема рабочая, хотя и с
нюансами. Если есть короткие импульсы, по которым надо
пробуждаться, то для них персонально можно выделить отдельные линии
EXTI. Как-то так...