ЕМНИП по поводу логики загрузки Xilinx там вначале должен светиться
светодиод INIT, а затем DONE. INIT при этом должен погаснуть. Это
если загрузка FPGA успешная. Посмотрите индикацию после включения,
быть может проблема в части Ethernet, а не в самой FPGA.