Кофакторы - всего лишь рабочие инструменты ферментов типа дрели или
паяльника :), но без специфики. А вот сам фермент сугубо специфичен
- ищет "деталь" (правильное название "субстрат"), на обработку
которой он рассчитан, захватывает ее так, чтобы сверло оказалось
точно под тем местом, где надо дырку сверлить. Затем сверлит дырку
и ослабляет хваты, а потом снова ищет точно такую же деталь, но
только без дырки. Т.е. совершенно разные ферменты могут
пользоваться одними и теми же инструментами (кофакторами), но обрабатывать разные детали и в разных местах их сверлить или спаивать. Потому и названия присваиваются ферментам от имени той детали, которую они сверлят/паяют, а не от названия инструментов, которыми пользуются. Например. фермент ксантокиназа "распиливает" ксантин до мочевой кислоты, а кофактор у нее - молибдоптерин.