Все что внутри частотника при наличии такой возможности можно
сделать без изоляции. Но входные цепи я бы не стал напрямую (даже с
защитами) пускать на основной МК. Потому, что внутри своего
устройства вы можете предусмотреть все пути протекания токов
питания и помех, а для "снаружи" нужно предполагать самое худшее,
т.н. "защиту от дурака".