Я бы предложил прежде всего сигналы сделать дифференциальными. При
сохранении пары на всей длине кабеля и трассы ПП это сильно
сократит как прием, так и излучение EMI. Можно ыще синфазных
дросселей поставить от Ethernet, они маленькие и дешевые. Есть диф. приемники и передатчики до 4 сигналов в корпусе. С питанием 3.3 В.