Если плату сохранить в ASCII, то можно поменять имена слоёв в
описании этих слоёв. В пикаде первые сколько-то слоёв имеют
фиксированные имена (список в шапке файла), а всё содержимое слоя
обрамлено тэгами, подобно XML (или html). На работе образца нет,
показать не могу, но структура файла очень понятная. Проще всего
создать пустую плату, провести на топе и боттоме дорожки для
идентификации и выяснить их имена. Потом поменять, дабы убедиться,
что я не налажал. Пикаду безразлична последовательность перечисления слоёв.