НЯП, порядок действий был следующий: 1. Стираем содержимое флэша:
- включаем плату (т.е. с помощью кабеля USB подключаем к ПК);
- подтягиваем сигнал ERASE в лог.'1';
- выжидаем 20 секунд;
- выключаем плату (отключаем от ПК);
- отцепляем ERASE от лог '1'
2. Активируем загрузчик:
- подтягиваем сигнал TST в лог.'1';
- включаем плату;
- выжидаем 10 секунд;
- выключаем плату;
- отцепляем TST от лог.'1'.
Если загрузчик не активировался, то SAM-BA железяку не увидит.
Кроме того, вместе с SAM-BA должен быть инсталлирован атмеловский драйвер виртуального COM-порта.
Еще смутно припоминая, что была какая-то особая фишка - то ли сначала плату включить, а потом сигналы подтягивать, то ли наоборот - сперва подтянуть, а потом включить. Попробуйте и так, и так.
И в "синем" SAM-ICE, помнится, золоченые площадки плоховато контачили (то ли покрыты чем-то, то ли окислились).
3. Далее прошиваем бинарник и обновляем прошивку - штатно.