Топологию платы изменил неудачно. Смотри внимательно контур тока 580кГц и где подключена сигнальная земля датчика тока стабилизатора 580кГц.
Ещё бы увидеть сравнение формы и положения импульсов между старым и новым вариантом.
Не исключаю, что правильная перемычка на плате решит проблему.