Что значит "PCINTы после выкл/вкл питания по прежнему не срабатывают" ?. Вопросы:
1) MAIN programm - данный код функционирует? Какая частота на выходе PD7?
M1:
sbi PORTD,PD7;Beep=1
...
cbi PORTD,PD7;Beep=0
...
rjmp M1
2) Проверить на наличие CLI (запрет перываний) без последующего SEI
3) Какое либо другое прерывание вызывает событие?
Код и листинг в студию!