caxapa.ru :: Я вынуждена пользоваться "заводским" софтом (Intel Math Kernel Library), т.к. мне самой такую процедуру не написать. А потому должна держать матрицу в рекомендуемом там формате. К тому же матрица и так уже максимально плотная - число ячеек равно числу пар белков N2/2, а потому, как ее не тасуй, меньше ячеек у нее не станет.

Kceния (19.07.2022 17:58, просмотров: 137) ответил LightElf на Я имею в виду, что возможно в вашем случае есть смысл рассмотреть разные варианты раскладывания матрицы в памяти, чтобы повысить кэш-локальность. Типа memory tiling в графике.

Я вынуждена пользоваться "заводским" софтом (Intel Math Kernel Library), т.к. мне самой такую процедуру не написать. А потому должна держать матрицу в рекомендуемом там формате. К тому же матрица и так уже максимально плотная - число ячеек равно числу пар белков N²/2, а потому, как ее не тасуй, меньше ячеек у нее не станет.

Ответить

- Вопрос не в "сделать меньше", а в том, что у современных компов память нифига не random-access и при больших объемах данных это надо учитывать. Но конечно, если используете чужую либу - то тут придется под чужую дудку плясать. - LightElf(19.07.2022 18:47)

Средства и методы разработки