В USB-COM, по крайней мере CP2102, поддержка аппаратного управления
потоком аппаратная, на уровне UART коневртера. И точно
останавливает передачу. Я гонял потоки до 1.5Мбит/с между МК и
CP2102, правда, для полного дуплекса пришлось ставить два CP2102.
Одна штука на моём тогдашнем ПК дуплекс 1.5Мбит/с не тянула. Так вот, RTS/CTS работали отлично! Ни байта потерь на десятках мегабайт. Правда, с полутора мегабит я до одного мегабита скорость потом снизил, мне физика мешала передавать полтора.