ARM, RISC-V контроллеры

То есть вот так не умеет парсить? Неудивительно. Место для переменной data выделяется и в модуле main и в модуле fun. Надо где-то в одном месте выделить. 

x.h

#pragma once /* то же что и "защита от многократного включения" */
extern int data;

main.c

#include "x.h"

int data = 0;

int main()
{
  return data;
}

fun.c

#include "x.h"

int data = 1;

int f()
{
  return data;
}