Я себе отдельный "стандартный" разъем с шагом 1.27мм для отладки
рисую сейчас на всех платах. Вот, как здесь, например: https://eddy-em.livejournal.com/396307.html(правда, там накосячил и слишком далеко его засунул: "прищепка" не достает", в следующем варианте он у меня на краю платы).
По USB: как только ни разводил, все равно работает, зараза ☺ В принципе, что ему будет-то на 12МГц? Аналогично с CAN (у меня скорости не выше мегабода, обычно вообще 250кбод). Там, кстати, на контроллере ШД и CAN разведен.
Пока не надо работать с очень высокими скоростями, не надо и париться насчет разведения дифпар и согласованных линий… Просто стараться не вести шумящие вещи около "нежных", а также покороче более-менее "скоростные" линии делать.
P.S. "Прищепку" для отладочного разъема на али брал, рублей 250 что ли стоило…