Два слоя (VCC+GND) смотрящие друг на друга через препрег это, кроме
удобства разводки, еще и распределенный конденсатор, который
неплохо давит ВЧ помехи. Ну а с точки зрения контролируемого импеданса ВЧ трассам все равно что под ними проходит (GND или VCC ). С термальной точки зрения разницы между VCC и GND так же нет - и то и то отводит тепло с равной эффективностью. Есть еще технологические заморочки (шаблоны, склейка, ....), но при современном уровне печатного дела ... их можно не учитывать в первом приближении. Так что правильный пирог должен выглядеть как: трассы-vcc-gnd-трассы. VCC с GND, разумеется, можно поменять местами на свой вкус.