Atmel практически для всех своих AT91SAM9 дает подробную документацию на EK и BSP на Linux и WinCE http://atmel.com/dyn/products/tools.asp?family_id=605 Если стартануть с линка по ссылке, то потом можно перейти на нужный чип, например для AT91SAM9261:
http://atmel.com/d …_card.asp?tool_id=3820
Кроме того есть отдельный ресурс по Линуксу для AT91SAM9
http://www.linux4s …ki/bin/view/Linux4SAM/