почему же без общего? общий провод источника сигнала можете соединить не с землей АЦП, а со средней точкой, к-рая, скажем, равна половине питания. Берете АЦП с дифф входом и питанием +5В, источник опоры 2.5В. "Общий" от источника сигнала соединяете с опорой. А на дифф. вход АЦП подаете входную пару через делитель на 2.