А крокодил земли по-прежнему ведь подключен был? Для измерения
масса осциллографа, он же земляной щуп должна быть подключена
допустим к средней точке сток-исток ключей. Иначе как померить?
Когда ты будешь подключать массу осциллографа куда-то на
высокочастотный потенциал где сотни или десятки вольт и "дёргать"
её туда-сюда, ничего хорошего ждать не надо (опустим вопрос, куда
она подключена сейчас, на реальное заземление или на ноль). И
вывешивание осциллографа на трансформаторной развязке проблему чуть облегчает, но не решает её. Для проектирования и
работы с БП тебе нужен дифференциальный щуп. (Именно его я так
понимаю попытались сэмулировать двумя каналами работающими в режиме A-B, но на самом деле это очень плохо работает, много мусора. Работает это только в случае дифф. щупа). Дифф. щуп либо купить, либо DIY Differential Probe.