Можно. В CubeMX на вкладке pinout&Configuration, где сверху
изображение корпуса, над корпусом находится выпадающее меню Pinout. В нем пункт List pinout Compatible MCUs.
В окне надо выбрать другой корпус.
Если навестись мышью на список, в выпадающей подсказке показывает что именно меняется
Двойной клик на выбранном CPU создает новый проект, но сигналы там где возможно сохранятся.
----------------
Я делал однажды сам вручную, на старой версии CubeMX когда всё работало плохо, уменьшая 144 корпус на 100й, редактируя вручную .ioc