Схемы, платы, компоненты

Так не разнести нормально. Входы одних частей схемы это выходы других, и по компоновке, получится неравномерная плотность трасс, на одном слое, условно "слева" плотнее, на втором, условно "справа", да и нерационально будет использована площадь. Я придерживаюсь немного иной парадигмы 4-слойной трассировки: 

- Top - верх, все цепи + питание (лучше 35мкм)

- Botton - низ, все цепи + питание (лучше 35мкм)

- IntSignal - "сигнальные линии, которые не удалось протащить по верху/низу, и в исключительных случаях - линии питания (можно 18мкм, но лучше 35)

- IntGround - "земляной полигон" и сигнальные линии и "перемычки" по "питанию" - то, что никак не получается в предыдущих трёх слоях (можно 18мкм, но лучше 35)

короткими трассы или "по краю", стараясь не резать полигон. Если режется, то соединяю кусками полигонов со множественными VIA на других слоях..

Дополнительно накрываю все слои полигонами GND и прошиваю равномерно VIA, а где нужно понадёжнее для Больших токов или теплоотвода - ставлю несколько/множественные VIA поплотнее.

приоритет - простоте трассировки и минимизации длины трасс (при таком подходе прыгаю со слоя на слой когда нужно, но стараюсь по минимуму)

Но, как обычно, - грамотная компоновка - 2/3 успеха хорошей трассировки. :)