Тогда 100% неправильный конструктив. Разгружайте разъём от
вибронагрузок. И да, разъёмы с "ловителями" типа ГРПМ отчасти
помогут, но там другая беда - их длина (если у Вас "двухрядка" при
хрупком материале корпуса (могут банально разламываться на
резонансных частотах платы) попробуйте увеличить жёсткость платы в
зоне разъёма, это изменит резонансные частоты. Как вариант - применить медь 35мкм вместо 18 и положить на всех слоях полигоны. Второй вариант (и одно другому не мешает) - "бэкплейт" - пластиночку/уголок прочного материала (предпочтительно жёсткий дюраль) с оборотной стороны платы (если будет место для притяжки его винтами к плате. Естественно, платы должны быть скреплены друг с другом не посредством разъёмов а именно механическим скреплением плат (или через жёсткие элементы несущего консмтруктива, или какими-нибудь "уголками")