От ПЛК/среды разработки зависит. Если поддерживается и то и то, то
разница будет скорее в оформлении. Если на ПК только FBD, некоторых
характерных особенностей LD обычно нет, в частности явной области
памяти под переменные к ячейкам которой можно обращаться по
номерам/адресам.