Пока не удалось найти донора на двутакт, решил произвести измерения
перемотанного трансформатора (не зря же перематывал) Итак, осциллограмма выброса ДО перемотки (была посегментная намотка первички и вторички):

После перемотки трансформатора (витки первички и вторички идут рядом - условно намотка в два провода)

Демпферы оставлены без изменений.
Мое прочтение осциллограммы: скорость нарастания напряжения увеличилась, количество энергии, которое необходимо погасить - несколько уменьшилось,
ширина полки сократилась с 300нс до 250нс. Опять лезет "хвостик", он и задает самое высокое значение напряжения выброса.
Сняты также дополнительные осциллограммы: напряжение первичной обмотки

... напряжение на шунте RCD-демпфера

и напряжение на емкости демпфера:

Из увиденного получается, что несовпадение токов первички и выходного дросселя увеличилось, стало >10А.
Вероятно это вызвано лучшей связностью обмоткок, меньшей несвязанной индуктивностью - ток за то же время нарастает быстрее.
Из осциллограмм сделан вывод, что значение несвязанной индуктивности составляет примерно 1.25мкГн, а по прошлым оценкам она была около 3.5мкГн.
Также предполагаю, что емкость демпфера к началу следующего периода разряжена слишком сильно, и сама потребляет некоторое количество энергии из первичной части (а не из энергии несвязанной индуктивности).
Ради интереса также снята осциллограмма с отключенным демпфером диода демпфера (RHRP860)

Дальнейший черновой план:
- уменьшить номинал шунта 7.5 Ом (т.к. пиковый поглощаемый ток увеличился)
- вернуть в электронную нагрузку сгоревший четвертый канал :-) и произвести оценку изменения выброса при увеличении тока нагрузки 10А до 15/20А
- переделать демпфер диода демпфера - попробовать уменьшить емкость 1000p до 470пф
- пересчитать/подобрать номиналы основного демпфера