Для считывания прошивки из МК 1. Нужно подать на микроконтроллер питание, либо запитать его от интерфейса программирования JTAG
2. Подключить его к компьютеру через программатор(по интерфейсу JTAG).
3. Считать прошивку с помощью программы поставляемой с программатором
Для того чтобы сравнить прошивку нужно получить в IAR файл прошивки в формате intel-extended.
Его можно получить, если в свойствах проекта, категории Linker, закладка output установить галочку Allow C-SPY-specific extra output file
На закладке Extra output категории Linker необходимо установить галочки Generate Extra output file;Override default. Output format: intel-extended,format variant:None.