32пФ заряженные 1.65В и разряжаемые на 0.01мкФ, дадут на последнем
2.64мВ подскок, а это уже больше трёх единиц МЗР 12-битной шкалы.
1.65В - это напряжение на входе SAR в момент выборки (обычно
наблюдал такое) и если входной сигнал далёк от этого напряжения,
например, 0В или 3.3В, то сдвиг будет максимальным. Если частота выборки будет высокой, то 0.01мкФ не будет успевать разряжаться/заряжаться до уровня полезного сигнала с приемлемой ошибкой. Поэтому нужно либо использовать малую ёмкость, либо низкую частоту выборки, чтобы этот подскок напряжения на входном конденсаторе от тока выборки, успевал рассасываться до следующей выборки. Иначе получите нелинейность шкалы - около середины ошибка 0, а к краям - максимальная, направленная к центру шкалы.
Определить подходящую ёмкость проще всего виртуальным экспериментом, смоделировав УВХ с параметрами АЦП - ёмкостью, сопротивлением ключа мультиплексора и с вашей входной цепью.