Там два варианта для отключённого при работе интерфейса: отладки
NRST и Power off. Оба поддерживаются WCH-LinkE. Я вывожу на отладочный порт три контакта - SWDIO, GND и VDD, если потребление платы позволяет запитать её от отладчика на время программирования. Отладчик подхватывает управление при включении питания, даже если отладочный интерфейс отключён в прошивке.
Вход сброса у меня не всегда включён. А вот питание обычно позволяет так сделать.