Первый и принципиальный момент, это разница в железе. У китайского СТ-Линк пин VCC, это выход питания. Поэтому работать они могут только с 3,3В таргетом. У оригинального СТ-Линк, пин VCC это вход VCCIO, поэтому они работают с любым таргетом. Т.е. китайский СТ-Линк надо подключать всего по 3-м проводам, иногда это даже удобнее.
Ну и с новой CubeMXProg клоны не работают, только со старой ST-Link Utility. С другой стороны, отладке из IDE на это покласть, клон или оригинал, например IAR одинаково работает что с одним, что с другим.
Лучше купить и тот, и другой. Клон не жалко, у меня их пяток валяется. А для отладки можно взять ST-Link Mini, брали осенью несколько штук на Озоне в районе 1-2т.р.