Ну, по переходным, похоже, заметка по ссылке от Винни Пох очень подходит. Я бы производителю плат рекламацию выставил, вместе со ссылкой на статью. Ну и морально быть готовым предоставить образцы для шлифов. Всё-таки, таких рваных краёв отверстий у электроконнекта, я ещё не видал.
Насчёт других переходных, можно прикинуть, зная, как платы были разложены на панели и сколько свёрел было на станке. Например, если было 4 шпинделя, то под подозрение попадает каждая четвертая плата. Поругайтесь, пусть хотя бы знают о проблеме. А то ни дай Бог, и мне такие переходные сделают...
Я бы забраковал все, у которых переходные изнутри не ровные.