Там же написано : Figure 1−7. GP Timer Compare/PWM Output in Up-Counting Mode
Figure 1−8. GP Timer Compare/PWM Output in Up-/Down-Counting Modes
Каждый может быть запрограммирован active low или active high.
Получаем разные осциллогнраммы
Вы про какой режим спрашиваете?
http://focus.ti.co …/spru065e/spru065e.pdf