Ориентируйтесь на пути Include в свойствах проекта. Достаточно
скопировать только те папки, которые "инклюдятся" в проект. Обычно,
это Startup, Ld, Core и Peripheral. Скопируйте папки и поправьте
пути в свойствах проекта, Include. Тогда всё будет находиться и всё
заработает в MRS автономно, без общей папки репозитория EVT. А чтобы перенести в Eclipse, придётся добавить ещё кучу настроек, которые в MRS входят в их фирменный шаблон проекта, но не переносятся автоматически в Eclipse. Но сделать это несложно - в MRS включаешь ключик -v при компиляции и смотришь ключи вызова компилятора и прописывашь их в Eclipse - часть прямо в GUI, под них есть поля. Часть - как дополнительные ключи компиляции. Мне удавалось добиться полной идентичности сборок в обоих средах. Может, найдёте мои заметки тут, на Сахаре, поиском "Eclipse" и "Nikolay_Po". Я нарочно оставлял во всех постах хотя бы одно слово "Eclipse" латиницей - чтобы потом можно было поиском найти инвариантно.