Первое, что на ум приходит, это поставить что-то на Cypress FX2LP. Правда, там всего 16 бит, так что в вашей FPGA придется их как-то мультиплексировать. Есть и готовый Dev Kit на ней. Или посмотреть киты логических анализаторов на этой микросхеме. http://www.cypress.com/?rID=14321
http://www.cypress.com/?id=193
Первое, что нагуглилось -
http://sigrok.org/wiki/Saleae_Logic