Даже не на порядок, а пожалуй, что и на два порядка. Причины отсутствия USB-бутлоадера при использовании RC-генератора в том, что UART теоретически может даже при 5% разбеге частот работать, и если для UART 0,5% за глаза для любых применений, то для USB в спецификации USB2.0 указано требование к тактированию USB-HOST ±0,05% на фреймовом интервале.
Since the Host Controller and hubs must meet clock accuracy specification of ±0.05%, they will automatically meet the frame interval requirements without the need for adjustment.
В микроконтроллерах, которые работают в индустриальном температурном диапазоне -40°C...+85°C и в диапазоне рабочих напряжений 2,7В...3,6В реализовать RC-генератор с точностью и стабильностью лучше ±0,5% - малореально. Не будут же производители МК вводить ограничение на использование USB-бутлоадера типа "только 3,3В±5% @ 25°C±20°C" :)