ARM, RISC-V контроллеры

Тогда при чем тут Сам-Ба? Не думаю, что Вам стоит что-то усложнять (вопросы Ваши позволяют думать, что Вы еще в начале пути), сделайте сперва хотя бы так как в доке описано. J-Link вам не поможет в НАНД записать файл, я даже затрудняюсь сказать как это возможно сделать. На вскидку могу предположить, что J-Link-ом Вы можете загрузить в SRAM или SDRAM некую программу, которая вам загрузит, по какому-то интерфейсу, в НАНД ваши файлы, но это с успехом делает и юбут, вы хотите написать свой юбут? Зачем изобретать велосипед? Скажу Вам по секрету, можете засунуть J-Link подальше в стол - он Вам врятли понадобится. JTAG теоретически может понадобиться только при отладке ядра. Если все-таки послушаетесь меня, то Сам-Бу надо подключать через USB, а на СОМ-порте они предлагают только посмотреть что стартанул BootRom.