Энергия заряженного до 5В конденсатора номиналом 10нФ составляет 0,125мкДж. Такой мизерной энергии не хватит не только чтобы "убить" пин, но и чтобы проявился тиристрный эффект, которого вы опасаетесь. Для сравнения, энергия статического разряда для типовой модели человеческого тела составляет около 1мДж. Почти на четыре порядка выше. А ведь МК протестирован и имеет защиту от статики.