У таких АЦП при работе в режиме с входным буфером, который актуален при работе с термопарами, потенциал на любом аналоговом входе должен быть > 0,5В. В АЦП для этого на AIN1 либо на AIN2 подключается источник напряжения смещения Vcc/2. Можете сделать это внешним делителем.