При старте ОС управление передается первому процессу. Он отдает второму (переключение происходит по прерыванию переключения контекста), второй-третьему и так далее пока не дойдет до prIdle. Вот там и дергается PORTC ^= (1<<3). И если прерывание компаратора не работает (не тот же вывод или не того же порта, например, у 128 меги заведен на вход компаратора) - переключения не произойдет. Вот туда и надо копать.