Если это не JTAG - я бы предположил, что он просыпается (и опять засыпает). Поэтому посмотрел бы содержимое RCC_CSR и PWR_CSR. Болтается в воздухе разве что сброс (NRST). WKUP pin rising edge,
RTC alarm event’s rising edge,
external Reset in NRST pin,
IWDG Reset.
In Standby mode, all I/O pins are high impedance except:
● Reset pad (still available)
● TAMPER pin if configured for tamper or calibration out
● WKUP pin, if enabled
