Противоречия давно нет. Венда как основная ОСь, Линух в гипервизоре. Вообще от задач сильно зависит. Что-от удонее программит под вендой, что-то под линухом. Все железо дрова под венду получает в первую очередь.
С появлением гипервизоров, которые могут поделить 2 видюхи между 2 системами, ваще вопросов не осталось.