Средства и методы разработки

имхо, от Neo4j слишком уж завязана на объектный подход. Другого ожидать трудно, поскольку всё завязано на жаву. Подкупает простота ввода графовой модели, и на этом всё заканчивается. Для описания поведения модели - пожалуйте в ту же жабу. Но самое хреновое даже не это. Народ бросился резко ваять тулзы типа анимотрона, накладывать всякие хитрые алгебры, но, справедливости ради, забыл отметить, что вид графа ни разу не определяет топологию, для которой выполняется реализованная алгебра. Вот такой капканец там внутри. По поводу того, чтобы напитонить или нациклевать:) навигатор по сырцам в графе, то для цэ есть кристалревс - его мощи по уши достаточно для гламурного эмбеддед. Сомневаюсь, что кто-то за штукобакс нациклюет что-то более информативное.