Комментарии C-препроцессор неплохо "херит". А отступы -- бесполезно, они программой indent восстанавливаются в виде лучше, чем есть у некоторых говнокодеров. А вообще обфускатор cobfusc входит в состав того же "комплекса ПО" cutils, что и indent и cdecl...