Ответ: можно и так, т.к. по сути АЦП один - единственный, а переключается входной мультиплексор. При этом соединены только 2 ноги, все прочие в высоком инмедансе.
Ну а в принципе, нечего ноги экономить. Выдели штатно на каждый сигнал свою пару и всё. У Analog Devices только два варианта: или фиксированные дифференциальные входы (AIN+ AIN-) или "псевдодифференциальный" вход (AINx)и земля (AINCOM)
Только в описанном выше случае я бы два резистора поставил (например, по 1k ThinFilm или С2-29) - первый RC фильтр "на землю", второй - синфазный.