Не совсем так. Я пишу в IAR, а родные файлы от fujitsu с API не подходят. Конечно, их можно поправить, но сначала я хотел проверить, как работает железо. В итоге я просто написал функцию, которая пишет по нужному адресу нужные данные (у меня же ARM там еще нужно слова в двойном слове местами поменять - у фуджика то Big Endian). В итоге это выглядит так:
JWrite(0xFC00,0x050FC807);
JWrite(0xFC04,0x00008800);
JWrite(0xFC04,0x00000800);
JWrite(0xFC04,0x00000FFF);
После записи, я читаю эти регистры, все правильно, в CLKPDR по мимо того что я записал появляется установленный бит VII (PLL lock (read only) 1: PLL has locked to input) frequency